E127系100番台は1998年に松本地区で営業運転を開始しました。
2連×12本=24両が松本車両センターに在籍します。
0番台との違いは 車体デザイン（扉間の開閉可能な窓が2段上昇となっているなど701系に近い）や、パンタグラフ（シングルアーム式のPS34に変更）、行先表示器（LED式に変更）などがあげられます。
一番の違いは座席です。大糸線が観光路線であるということから西側（北アルプス側）がクロスシートとなるセミクロスシートとなっています。
1999年からはワンマン運転も始まりました。
目次
E127系100番台 A編成 2連
JR東日本 E127系100番台 A1～12編成2連 大糸線、篠ノ井線用
←①塩尻、松本 南小谷②→
ｸﾓﾊE127_100-ｸﾊE126_100
1998.11に新製 編成番号と車番下二桁は対応している。A1～12が在籍。
参考：JR電車編成表2010年夏版
A9編成① クモハE127形100番台 クモハE１２７-１０９
A9編成② クハE126形100番台 クハE１２６-１０９
撮影2007.7：松本
A10編成① クモハE127形100番台 クモハE１２７-１１０
撮影2007.7：南小谷
A10編成② ｸﾊE126形100番台 クハE１２６-１１０
A10～12については クハにも霜取り用ﾊﾟﾝﾀが付く。撮影2007.7：南小谷
